净化车间设计是指控制室内净化，在要求范围内排除漂浮在空气中的颗粒、有害空气、细菌等污染物，并给予特殊设计的房间。
1、净化车间的设计应综合考虑空气净化系统的布局、气流类型的选择和管道系统的布置，进行建筑物的平面和剖面设计，并在工艺步骤的基础上，适当处理净化房与非净化房、不同净化等级房之间的关系，使净化要求高、净化要求低的房间处于正压状态，增加气密性。
2、还要注意建筑物内部的噪声控制，隔离外部噪声干扰，注意防火，以及紧急情况下人员的安全疏散。人员和物料入口应分开设置，避免人员和物料流线路来回交叉。净化流线应清晰、短、反向净化气流。
3、净化车间表面光滑平整，尽量减少除尘面，轮廓要简洁。净化车间的设计应适当确定厂房的耐火等级和天花板、墙壁等材料的耐火极限，以及消防入口和通道的配置。综合考虑生产工艺、气流组织、管道敷设方式、照明和建筑空间处理等因素，确定合适的剖面形式和层高，节约能源，简化结构，降低成本。
四、净化车间的室内设计要营造宜人的心理环境，减少压抑感。